在繁华都市的霓虹灯下，一场突如其来的灾难悄然改变了几个人的命运。这部电影以一座不断扩张的城市为背景，讲述了三个家庭之间错综复杂的关系以及隐藏在表面平静下的秘密。

故事从年轻警官阿云的成长轨迹开始。他自幼目睹父亲因调查一桩案件而失踪，母亲也因此郁郁寡欢。成年后的阿云继承了父亲的职业理想，却始终无法解开父亲案件背后的谜团。随着调查深入，他发现这不仅仅是一起普通的刑事案件，更牵扯到城市发展中不可告人的利益交换。

与此同时，另一条线索围绕着富商林东展开。林东表面上是一位成功的企业家，但他的财富背后却是通过不正当手段积累起来的。为了维护自己的地位和权力，他不惜牺牲身边的人，甚至包括自己深爱的女儿。女儿林若曦逐渐察觉到父亲的秘密，她试图逃离这个充满欺骗与背叛的家庭，却发现自己早已被卷入了一场更大的阴谋之中。

影片还刻画了一对普通夫妻的生活点滴。丈夫李建国是一名普通的建筑工人，妻子陈梅则是一名小学教师。他们的生活看似平凡无奇，实则承载着对美好未来的憧憬。然而，在城市的快速变迁中，他们赖以生存的土地即将被征用，梦想也随之破碎。面对现实的压力，两人不得不做出艰难的选择。

导演巧妙地将这些人物的命运交织在一起，通过细腻的情感描写和紧张的情节推进，展现了现代社会中人与人之间的疏离感以及追求真相的勇气。影片不仅是一部悬疑片，更像是一首关于人性与社会的诗篇。

最终，在真相揭露之时，每个人都面临着内心深处的挣扎与救赎。《风中有朵雨做的云》以其独特的视角和深刻的主题，让观众思考如何在纷繁复杂的世界中找到属于自己的方向。